تضم جامعة فهد بن سلطان ٦٣ معملا تقع على مساحة ٤٠٠٠ متر مربع وبقدرة استيعابية تصل الي ١٢٦٠ طالبا وطالبة في ان معا. وقد تم تجهيز كافة هذه المعامل بمختلف الوسائل الحديثة من حواسب و اجهزة عرض رقمية تسمح بخدمة الانترنت بشكل مباشر. وتتوزع هذه المعامل على الكليات التالية:

كلية الهندسة

قامت الجامعة حديثاً بالتعاون مع الجامعة الأميركية في بيروت بإنشاء معامل متطورة في الهندسة المدنية والكهربائية. وتشمل هذه المختبرات :

   • مختبر ميكانيكا التربة

   • مختبر الإنشاءات

  • مختبر المواد

  • مختبرالهيدرولوجيا 

  • مختبر الأبنية

  • مختبر الهندسة البيئية

  • مختبر المساحة الأرضية

  • مختبر الطرق والمرور

  • مختبر الرسم الهندسي

ويقدم قسم الهندسة الكهربائية للطلاب خبرة عملية متقدمة من خلال أحدث المختبرات التعليمية ومختبرات الأبحاث المتطورة بما في ذلك:

    • مختبر الدوائر الكهربائية

   • مختبر الأنظمة الرقمية

   • مختبر الالكترونيات

   • مختبر الطاقة (قبد الإنشاء)

   •  مختبر حديث للآلات والمعدات الكهربائية  

هذا بالإضافة إلى معامل الحاسوب المتخصصة  ببرامج محاكاة لأنظمة السيطرة والتحكم،  والانظمة الالكترونية، وأنظمة الاتصالات والطاقة.

كلية الحاسب

أما كلية الحاسب فتضم المختبرات التالية:

    •  مختبرات البرمجة

   •  مختبر الدوائر المنطقية

   •  مختبر الشبكات

   •  مختبر الدوائر الكهربائية والإلكترونيات

   •  مختبر نظم التشغيل

   •  مختبر الروبوتات

   •  مختبر مشاريع التخرج والإبتكار

كلية العلوم والدراسات الإنسانية

أما كلية العلوم فتوفر لطلبة الجامعة المختبرات التالية:

   •  مختبر كيمياء عامة

   •  مختبر فيزياء عامة ١

   •  مختبر فيزياء عامة ٢

   • مختبر اللغة الإنجليزية ١   

   • مختبر اللغة الإنجليزية ٢

كلية إدارة الأعمال

أما كلية إدارة الأعمال، فتستعين بمعامل البرمجة المتوفرة و تستخدم العديد من البرامج لتعزيز الجانب التطبيقي من دراسة الأعمال ومن هذه البرامج تطبيقات المحاسبة والإحصاء وصنع القرار.